万方查重和知网查重都是常用的学术查重工具，但二者在使用体验、查重算法、覆盖范围等方面有所不同。万方查重主要以中文文献为主，覆盖范围较广，但在检测速度和准确性上稍显不足。知网查重则更注重学术领域的专业性，对于学术论文的查重效果更为精准，但覆盖范围相对较窄。因此，选择查重工具时需根据具体需求和研究领域进行权衡。

此外，万方查重和知网查重在用户界面设计、报告输出形式、价格等方面也存在差异。万方查重通常提供更加友好的操作界面，报告输出形式更为直观，但价格相对较高。知网查重则在报告输出的专业性和详尽程度上有优势，价格相对较为亲民。因此，用户在选择查重工具时还需考虑自身实际需求和经济承受能力，综合评估二者的优劣势，选择最适合自己的学术查重工具。